Solución:
Desde el apt-get página man:
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limpio: clean borra el repositorio local de archivos de paquetes recuperados. Elimina todo menos el archivo de bloqueo de / var / cache / apt / archives / y / var / cache / apt / archives / partial /. Cuando se utiliza APT como método dselect (1), clean se ejecuta automáticamente. Aquellos que no usan dselect probablemente querrán ejecutar apt-get clean de vez en cuando para liberar espacio en el disco.
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limpieza automática: Al igual que clean, autoclean borra el repositorio local de archivos de paquetes recuperados. La diferencia es que solo elimina los archivos de paquetes que ya no se pueden descargar y son en gran parte inútiles. Esto permite que una caché se mantenga durante un período prolongado sin que se salga de control. La opción de configuración APT :: Clean-Installed evitará que los paquetes instalados se borren si está desactivada.
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autoremove: se utiliza para eliminar paquetes que se instalaron automáticamente para satisfacer las dependencias de algún paquete y que ya no son necesarios.
Cada comando tiene una página de manual, si desea saber cuáles son sus parámetros o qué hace cada uno de ellos, simplemente escriba en el shell `man` Ex. `hombre apt-get`
- página de manual para el
apt-getmando
autoclean: elimina todos los archivos almacenados en su caché para los paquetes que ya no se pueden descargar (por lo tanto, los paquetes que ya no están en el repositorio o que tienen una versión más reciente en el repositorio).
clean: elimina todos los archivos almacenados en su caché.
autoremove: una cosa completamente diferente, esta opción hace que apt busque paquetes que estén instalados como dependencia de un paquete ya desinstalado y los elimine. Esto se usa para limpiar las dependencias no utilizadas que permanecen en su sistema.
Respuesta encontrada: http://ubuntuforums.org/showthread.php?t=394952