Solución:
Para recortar un mapa ráster de acuerdo con un mapa vectorial, puede utilizar r.mask, que también admite mapas vectoriales.
Actualización 2018: Mientras tanto, hay v.clip y un nuevo complemento disponible: r.clip
Sé que es tarde, pero para otros que tienen la misma pregunta. Por favor intente esto:
# limit your computational region to polygon_vector
r.mask vect=polygon_vector
# clip big_raster to polygon_vector (MASK set by r.mask above)
r.mapcalc ex=clipped_raster=big_raster
# export
r.out.gdal input=big_raster output=clipped_raster.tif
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