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Trazar matriz de confusión en R usando ggplot

Este equipo de especialistas despúes de ciertos días de investigación y recopilar de datos, dieron con los datos necesarios, deseamos que resulte útil para ti para tu trabajo.

Solución:

Esto podría ser un buen comienzo

library(ggplot2)
ggplot(data =  dframe, mapping = aes(x = label, y = method)) +
  geom_tile(aes(fill = value), colour = "white") +
  geom_text(aes(label = sprintf("%1.0f",value)), vjust = 1) +
  scale_fill_gradient(low = "white", high = "steelblue")

editado

TClass <- factor(c(0, 0, 1, 1))
PClass <- factor(c(0, 1, 0, 1))
Y      <- c(2816, 248, 34, 235)
df <- data.frame(TClass, PClass, Y)

library(ggplot2)
ggplot(data =  df, mapping = aes(x = TClass, y = PClass)) +
  geom_tile(aes(fill = Y), colour = "white") +
  geom_text(aes(label = sprintf("%1.0f", Y)), vjust = 1) +
  scale_fill_gradient(low = "blue", high = "red") +
  theme_bw() + theme(legend.position = "none")

ingrese la descripción de la imagen aquí

Una solución un poco más modular basada en la respuesta de MYaseen208. Podría ser más efectivo para grandes conjuntos de datos/clasificación multinomial:

confusion_matrix <- as.data.frame(table(predicted_class, actual_class))

ggplot(data = confusion_matrix
       mapping = aes(x = Var1,
                     y = Var2)) +
  geom_tile(aes(fill = Freq)) +
  geom_text(aes(label = sprintf("%1.0f", Freq)), vjust = 1) +
  scale_fill_gradient(low = "blue",
                      high = "red",
                      trans = "log") # if your results aren't quite as clear as the above example

Aquí hay otra opción basada en ggplot2; primero los datos (de intercalación):

library(caret)

# data/code from "2 class example" example courtesy of ?caret::confusionMatrix

lvs <- c("normal", "abnormal")
truth <- factor(rep(lvs, times = c(86, 258)),
                levels = rev(lvs))
pred <- factor(
  c(
    rep(lvs, times = c(54, 32)),
    rep(lvs, times = c(27, 231))),
  levels = rev(lvs))

confusionMatrix(pred, truth)

Y para construir las parcelas (sustituya su propia matriz a continuación según sea necesario al configurar la "tabla"):

library(ggplot2)
library(dplyr)

table <- data.frame(confusionMatrix(pred, truth)$table)

plotTable <- table %>%
  mutate(goodbad = ifelse(table$Prediction == table$Reference, "good", "bad")) %>%
  group_by(Reference) %>%
  mutate(prop = Freq/sum(Freq))

# fill alpha relative to sensitivity/specificity by proportional outcomes within reference groups (see dplyr code above as well as original confusion matrix for comparison)
ggplot(data = plotTable, mapping = aes(x = Reference, y = Prediction, fill = goodbad, alpha = prop)) +
  geom_tile() +
  geom_text(aes(label = Freq), vjust = .5, fontface  = "bold", alpha = 1) +
  scale_fill_manual(values = c(good = "green", bad = "red")) +
  theme_bw() +
  xlim(rev(levels(table$Reference)))

Opción 1

# note: for simple alpha shading by frequency across the table at large, simply use "alpha = Freq" in place of "alpha = prop" when setting up the ggplot call above, e.g.,
ggplot(data = plotTable, mapping = aes(x = Reference, y = Prediction, fill = goodbad, alpha = Freq)) +
  geom_tile() +
  geom_text(aes(label = Freq), vjust = .5, fontface  = "bold", alpha = 1) +
  scale_fill_manual(values = c(good = "green", bad = "red")) +
  theme_bw() +
  xlim(rev(levels(table$Reference)))

opcion 2

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