Te sugerimos que pruebes esta solución en un entorno controlado antes de pasarlo a producción, un saludo.
Solución:
Tuve un error similar con Linux Mint
error fatal: sys/types.h: No existe tal archivo o directorio
Solucionado este problema con:
sudo apt install libc6-dev
Sugiero mirar a ver si gcc está buscando archivos de encabezado en el directorio donde se encuentra su archivo con el comando:
`gcc -print-prog-name=cc1` -v # for c
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