Esta es el arreglo más acertada que encomtrarás brindar, pero primero estúdiala detenidamente y valora si se puede adaptar a tu trabajo.
Solución:
Desde la ventana de MySQL Workbench 5.2, seleccione Base de datos -> Sincronizar modelo, lo que le permitirá sincronizar el modelo (diagrama EER) con la base de datos (necesita crear una conexión guardada) para ello.
Recomiendo este método en lugar de simplemente aplicar ingeniería inversa al modelo de la base de datos, ya que mantiene el diseño del diagrama EER. Una advertencia es que debe agregar nuevas tablas al diagrama EER manualmente.
Una cosa que debe tener cuidado con ‘Base de datos’ -> ‘Sincronizar’ es que por defecto aplica los cambios del diagrama a la base de datos en vivo, es decir, sugiere declaraciones como:
BAJAR LA TABLA SI EXISTE h2.Import_Homol
Tenga cuidado de cambiar este comportamiento predeterminado si solo está utilizando la herramienta EER para los diagramas de salida, o sus tablas en vivo se eliminarán si no existen en el modelo (al igual que las columnas adicionales o cualquier otro cambio de esquema).
http://dev.mysql.com/doc/workbench/en/wb-database-synchronization.html
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