Solución:
GitHub Pages está haciendo lo que está diseñado para hacer: alojar todo ese repositorio. La raíz del repositorio solo contiene un único archivo (README.md). Hay otras páginas, por ejemplo, https://inquisitivedev2016.github.io/Photo%20Website/webpage.html, pero no hay una manera fácil de navegar hasta ellas.
Considere mover su contenido web a la raíz de su repositorio y cambiar el nombre de su página predeterminada a index.md o index.html, dependiendo del tipo de archivo. (Por convención, la página predeterminada de la mayoría de los sitios web se llama index.html, y esto es lo que las páginas de GitHub mostrarán de forma predeterminada si existe).
Github te ofrece múltiples opciones de dónde toma sus fuentes. De forma predeterminada, es la raíz de la rama maestra, que utilizará la README.md en caso de que no haya index.html.
Pero también puede cambiar al docs/ carpeta en la configuración de su repositorio. Con eso puedes poner el index.html bajo la docs/ carpeta.
Ver 
Cree un index.html en la raíz e inserte la línea
<meta http-equiv="Refresh" content="2; url=public/index.html">
O eso funcionó para mí con un proyecto de Vue CLI con el que tuve este problema.