Posteriormente a consultar especialistas en el tema, programadores de diversas áreas y maestros hemos dado con la respuesta al problema y la dejamos plasmada en esta publicación.
Solución:
En la actualidad, no hay soporte nativo de varias páginas en Inkscape debido a las limitaciones de las especificaciones SVG estrictamente implementadas (el soporte de varias páginas solo se introdujo en el borrador de SVG 1.2. que nunca se lanzó pero se abandonó a favor del próximo SVG 2.0).
Para superar esto, un complemento externo, inkscape-pages, brinda soporte para varias páginas mediante la generación de una página maestra con enlaces a subpáginas. Sin embargo, este complemento no producirá código SVG 2.0 para compatibilidad futura. Sin embargo, ayudará a crear varias páginas para exportarlas posteriormente a PDF (por ejemplo, con la ayuda de pdftk 
).
Si no hay muchas páginas, intente guardarlas como archivos PDF separados de una sola página después de editarlos con Inkscape y luego combínelos con alguna herramienta como el relleno de PDF. No sé si puede dar lugar a algunos problemas más adelante, pero funcionó para mí cuando probé con 3 archivos PDF.
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