Solución:
Acabo de encontrar el mismo problema. El problema para mí fue el programa de descompresión predeterminado de Windows 7. Tiene un problema cuando encuentra archivos que tienen una estructura de archivos profunda. Leí sobre este tema hace algún tiempo, pero no recuerdo el artículo. La solución para mí es descomprimir la descarga de Eclipse usando WinZip (o alguna otra herramienta que no tenga este problema).
Eso suena bastante mal y extraño. Pero reinstalar no es tan difícil: descargue, descomprima, cambie la asignación de memoria predeterminada, ejecute Eclipse, instale los complementos y funciones necesarios.
Y casi todas las preferencias importantes están en su espacio de trabajo. El único importante en el que puedo pensar fuera del espacio de trabajo es la asignación de memoria antes mencionada, que puede configurar en la línea de comando o en el archivo ECLIPSE.INI.
Compruebe eclipse.ini, hay dos entradas como:
-startup
plugins/org.eclipse.equinox.launcher_1.3.0.v20120522-1813.jar
--launcher.library
plugins/org.eclipse.equinox.launcher.gtk.linux.x86_64_1.1.200.v20120913-144807
Por alguna razón retorcida, los jar tienen una versión en su nombre, por lo que si actualiza / tiene dos versiones diferentes de eclipse (mientras que eclipse.ini está vinculado o se proporciona como un archivo de configuración de todo el sistema para eclipse), causará el error anterior.