Solución:
Prueba Cinelerra.
Cinelerra es el editor y compositor de video no lineal más avanzado para Linux. Cinelerra también incluye un motor de composición de video, que permite al usuario realizar operaciones de composición comunes como incrustaciones y mates.Cinelerra
Para descargar haga clic aquí. (Editar: o instalar en 12.04 con los siguientes comandos).
sudo apt-add-repository ppa:cinelerra-ppa/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install cinelerra-cv
También puedes probar OpenShot.
OpenShot tiene muchas características excelentes, como recortar y organizar videos, ajustar niveles de audio, transiciones entre videos, componer múltiples capas de video, efecto de pantalla verde / clave de croma y compatibilidad con la mayoría de formatos y códecs.
Lo que realmente distingue a OpenShot de otros editores de video es la interfaz de usuario fácil de usar.OpenShot
Para instalar OpenShot, simplemente presione control+Alt+T en su teclado para abrir Terminal. Cuando se abra, ejecute los siguientes comandos:
sudo add-apt-repository ppa:openshot.developers/ppa
sudo apt-get update
sudo apt-get install openshot openshot-doc
Kdenlive
Una de las aplicaciones más fascinantes se puede encontrar en Ubuntu de forma gratuita.
Puede realizar casi todas las funciones que pueden hacer las aplicaciones famosas disponibles comercialmente.
Entrada y salida con muchos formatos.
Puede crear superposiciones creativas, incluidos títulos, encabezados, etc.
Tiene muchas funciones para pistas.
Muchos efectos y transiciones de video y audio.
Puede hacer captura de video usando una cámara externa, una cámara web o una captura de pantalla.
También puede instalar en Terminal con:
sudo apt-get install kdenlive kdenlive-data
También puedes probar Lightworks.
Otra gran opción es Blender. Aquí hay un buen tutorial del editor de secuencias de video.