Solución:
Si no incluyó JavaEE Persistance cuando creó su proyecto como sugirió @Freek de Bruijn, puede ingresar a:
File - > Project Structure - > Modules -> + -> "JPA"
Eso permitirá persistence debajo Tool windows también si, como yo, verificaste tu proyecto desde el control de versiones. Me tomó bastante tiempo encontrar esa configuración en realidad.
El soporte de persistencia está disponible en IntelliJ IDEA Ultimate Edition (y no en Community Edition, creo). Cuando crea un nuevo proyecto en, por ejemplo, IntelliJ IDEA 15.0.3 EAP (compilación 143.1453.5), se abre el cuadro de diálogo Nuevo proyecto:
Allí, por ejemplo, puede seleccionar “Java Enterprise” en el panel izquierdo y “JavaEE Persistence (2.0)” en la lista “Bibliotecas y marcos adicionales”. Ahora el panel de Persistencia se puede abrir a través de Ver | Ventanas de herramientas | Menú de persistencia. El panel de Persistencia es visible aquí en la parte inferior izquierda:
Haciéndose eco de lo que dijo @ 0x6C38 aquí. Archivo-> Estructura del proyecto -> Módulos -> + luego escriba JPA.
Entonces lo tendrá en las ventanas de herramientas.
