¿Cómo ocultar la línea del eje y en ChartJs?

Solución:

Esto desactiva la línea vertical del eje Y:

options: {
  scales: {
    yAxes: [{
      gridLines: {
        drawBorder: false,
      },
    }]
  },
},

Esto se puede combinar con display para deshabilitar las líneas verticales de la cuadrícula:

xAxes: [{
  gridLines: {
    display: false,
  },
}],

Aquí hay un ejemplo de trabajo: http://codepen.io/anon/pen/xqGGaV

var myBubbleChart = new Chart(ctx,{
    type: 'bubble',
    data: data,
    options: {
        scales:
        {
            yAxes: [{
                gridLines : {
                    display : false
                }
            }]
        }
    }
});

var ctx = document.getElementById("myChart");

var data = {
    datasets: [
        {
            label: 'First Dataset',
            data: [
                { x: 20, y: 30, r: 10 },
                { x: 40, y: 10, r: 10 },
                { x: 30, y: 20, r: 30 }
            ]
        }]
};

var myBubbleChart = new Chart(ctx,{
    type: 'bubble',
    data: data,
    options: {
        scales:
        {
            yAxes: [{
                display: false
            }]
        }
    }
});

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