Solución:
Funciona para mi despues de correr
pdflatex file
bibtex file
pdflatex file
pdflatex file
Quité el ./ del estilo de bibliografía, ya que no está instalado en el directorio actual.
Guardé la entrada de bibliografía que publicaste como ref.bib en el directorio actual, y el código siguiente como file.tex
documentclass[a4paper,11pt]{article}
usepackage[T1]{fontenc}
usepackage[utf8]{inputenc}
usepackage{lmodern}
usepackage[hidelinks]{hyperref} % Hyperref package for url's and [hidelinks] option to remove collouring
title{Test}
author{Thanos}
begin{document}
maketitle
tableofcontents
begin{abstract}
This is abstract
end{abstract}
section{Section 1}
Referecnce example~cite{ref:thanos}
bibliographystyle{IEEEtran}
bibliography{ref}
end{document}
La respuesta de David Carlisle es muy completa, pero recientemente enfrenté la misma situación cuando estaba trabajando en un segundo artículo y quería que tuviera el mismo formato que mi primer artículo. Copié el archivo .cls, el archivo .tex y el archivo .bib y recibí exactamente el mismo error que OP.
LaTeX Warning: Citationref:thanos' on page 1 undefined on input line 21.
Siguiendo los pasos de la respuesta anterior, no pude resolver mi problema. Resulta que para resolver mi problema también necesitaba copiar el archivo .bst de la carpeta de mi primer trabajo o el archivo de estilo de bibliografía. Al copiar el archivo .bst, pude resolver mi problema.
Recientemente he experimentado el mismo problema al escribir mi tesis doctoral.
Tiene un archivo maestro y todos los capítulos, etc. se agregan con input mando.
Recientemente, para acelerar el tiempo de compilación, comencé a usar includeonly. No tuve este error hasta que reemplacé input con include para agregar los capítulos. Entonces, me di cuenta de que chapterbib es adecuado para trabajar con include no con input. Entonces, cuando estaba usando input, chapterbib Estaba inactivo y nunca lo necesité porque imprimo la bibliografía al final de la tesis, no por separado para cada capítulo.
En pocas palabras, desactivé chapterbib y volvió a funcionar normalmente. Espero que esto pueda ayudar a los que experimentan la misma dificultad.