Ya no necesitas investigar más por todo internet porque estás al sitio justo, poseemos la solución que quieres pero sin problema.
Solución:
ClaimsIdentity.IsAuthenticated devoluciones false cuando ClaimsIdentity.AuthenticationType es null o vacío. Para evitar eso, deja de usar el parámetro sin parámetros. ClaimsIdentity constructor y usa la sobrecarga aceptando un authenticationType parámetro:
var userIdentity = new ClaimsIdentity("Custom");
En mi caso el problema estaba en el archivo de inicio. La línea app.UseAuthentication() venía después de la línea app.UseMvc(). Invertí las órdenes y comenzó a funcionar.
Sé que esta pregunta se hizo hace mucho tiempo, pero podría ser útil para otra persona.
Utilizando app.UseAuthentication(); justo antes de app.UseAuthorization(); dentro del método Configurar en la clase Startup.cs lo arregló para mí.
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