Omar, miembro de este gran equipo de trabajo, nos ha hecho el favor de crear esta crónica ya que conoce a la perfección dicho tema.
Solución:
El PDF etiquetado es un archivo PDF que contiene metainformación sobre ciertos grupos de instrucciones PDF dentro del contenido de una página. Esta metainformación tiene muchos casos de uso: extracción de texto, reflujo de contenido, accesibilidad de documentos, información geográfica en PDF que contiene mapas, etc.
Si necesitas conocer más detalles sobre este tema te recomiendo leer Chapter 10 - Document Interchange de Adobe PDF Reference versión 1.7.
La razón principal por la que se utiliza es por accesibilidad. Con las etiquetas correctas, un lector de pantalla (para una persona ciega) puede entender dónde caen los encabezados, qué es una tabla/nota al pie/gráfico, etc. También hay una característica llamada PDF Article Threading que es útil para diseños de revistas o periódicos donde un artículo se divide en cuadros/páginas.
Al final de todo puedes encontrar las acotaciones de otros creadores, tú además eres capaz insertar el tuyo si te gusta.