Solución:
OK, lo arreglé.
En el menú, en Archivo, hay una opción de invalidación de caché. ¡Eso lo arregló!
En el IDE más reciente (a partir de Community Edition 2016.1), esta opción está más simplificada.
haga clic con el botón derecho en la carpeta que desea que se reconozca como carpeta de origen:
Marcar directorio como -> Raíz de fuentes
Solo para agregar un escenario diferente, que me sucedió a mí y a algunos de mis compañeros de trabajo:
Alt + ingresar en la clase -> crear prueba: IJ (2017.1.1) propone Arquillian Junit como primera opción de biblioteca de prueba y al ir con ella la clase de prueba y los métodos se crean sin el identificador ‘público’. Entonces, si uno decide cambiar la biblioteca de pruebas a JUnit, es fácil olvidarse de la ausencia del identificador ‘público’, lo que hace que IJ no reconozca las pruebas. Por supuesto, la solución es colocar los identificadores “públicos”.
Aunque esto no es lo que le sucedió a usted, tiene la misma consecuencia, por lo tanto, esta respuesta puede ayudar a otras personas a experimentar los mismos síntomas.