Solución:
Pensé que dejaría esta respuesta en caso de que alguien la vea ahora. Parece que han limpiado esto desde que se les preguntó, y esa antigua wiki no enlaza bien con el sitio web actual:
También hay instrucciones de instalación completas aquí https://www.orfeo-toolbox.org/CookBook/Installation.html donde tienen scripts de instalación descargables para ejecutar.
Si está usando ubuntu, también puede hacer
sudo apt install aptitude
sudo aptitude install add-apt-repository
sudo apt-add-repository ppa:ubuntugis/ubuntugis-unstable
sudo aptitude install otb-bin otb-bin-qt python-otb
Esto fue lo que funcionó para mí después de 30 minutos de probar una compilación completa desde la fuente.
Desde QGIS 3.8, el complemento del proveedor OTB es parte del núcleo de QGIS pero está deshabilitado de forma predeterminada (habilítelo en Opciones-> Procesamiento-> Proveedores). Instale OTB (descárguelo de https://www.orfeo-toolbox.org/download/) antes de habilitar el complemento.
Antes de QGIS 3.8, instale OTB y agregue el repositorio de complementos http://orfeo-toolbox.org/qgis/plugins.xml (pasos detallados en https://gitlab.orfeo-toolbox.org/orfeotoolbox/qgis-otb-plugin ) para el complemento del proveedor OTB.
Configuración de complemento de ejemplo en Windows:
Activate: (check the box)
OTB application folder: C:/OTB-6.6.1-Win64/lib/otb/applications
OTB folder: C:/OTB-6.6.1-Win64
Lo hice siguiendo esto: http://wiki.orfeo-toolbox.org/index.php/Quantum_GIS_access_to_OTB_applications