Gabriel, parte de este gran staff, nos hizo el favor de crear este post porque controla muy bien este tema.
Ejemplo: ggplot: diagrama de caja con línea de tendencia
ggplot(iris, aes(factor(Sepal.Length), Sepal.Width))+
geom_boxplot()+
geom_smooth(method ="lm", se=FALSE, color="black", aes(group=1))
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