Saltar al contenido

¿Cuánto almacenamiento se necesitaría para almacenar un genoma humano?

Presta atención ya que en este artículo vas a hallar el arreglo que buscas.

Solución:

Si confía en tales cosas, esto es lo que dice Wikipedia (de http://en.wikipedia.org/wiki/Human_genome#Information_content):

Los 2.900 millones de pares de bases del genoma humano haploide corresponden a un máximo de unos 725 megabytes de datos, ya que cada par de bases puede codificarse mediante 2 bits. Dado que los genomas individuales varían en menos del 1% entre sí, se pueden comprimir sin pérdidas a aproximadamente 4 megabytes.

No almacena todo el ADN en una sola secuencia, sino que la mayor parte del tiempo se almacena en los cromosomas.

Un cromosoma grande ocupa unos 300 MB y uno pequeño unos 50 MB.


Editar:

Creo que la primera razón por la que no se guarda en 2 bits por par de bases es que causaría un obstáculo para trabajar con los datos. La mayoría de la gente no sabría cómo convertirlo. E incluso cuando se ofrece un programa para la conversión, muchas personas en grandes empresas o institutos de investigación no pueden/necesitan preguntar o no saben cómo instalar programas…

El almacenamiento de 1 GB no cuesta nada, incluso la descarga de 3 GB toma solo 4 minutos con 100 Mbitsps y la mayoría de las empresas tienen velocidades más rápidas.

Otro punto es que los datos no son tan simples como te dicen.

Por ejemplo, el método de secuenciación inventado por Craig_Venter fue un gran avance, pero tiene sus inconvenientes. No pudo separar cadenas largas del mismo par de bases, por lo que no siempre está 100% claro si hay 8 A o 9 A. Cosas de las que tienes que ocuparte más adelante…

Otro ejemplo es la metilación del ADN porque no puede almacenar esta información en una representación de 2 bits.

Básicamente, cada par de bases toma 2 bits (puede usar 00, 01, 10, 11 para T, G, C y A). Dado que hay alrededor de 2,9 mil millones de pares de bases en el genoma humano, (2 * 2,9 mil millones) bits ~= 691 megabytes.

No soy un experto, sin embargo, la página del Genoma Humano en Wikipedia dice lo siguiente:

MB sin procesar:

  • Hombre (XY): 770 MB
  • Mujer (XX): 756 MB

No estoy seguro de dónde proviene su varianza, pero estoy seguro de que puedes resolverlo.

Si guardas alguna desconfianza y forma de limar nuestro crónica puedes escribir una disquisición y con placer lo analizaremos.

¡Haz clic para puntuar esta entrada!
(Votos: 0 Promedio: 0)



Utiliza Nuestro Buscador

Deja una respuesta

Tu dirección de correo electrónico no será publicada. Los campos obligatorios están marcados con *