Solución:
Debería obtener una ventana con una lista de repositorios o un menú de texto con algunas opciones. Pero si eso no aparece, siempre puede especificar el espejo desde donde descargar los paquetes usted mismo usando repos parámetro. Al hacer eso, R ya no le preguntará sobre el repositorio. Ejemplo:
install.packages('RMySQL', repos="http://cran.us.r-project.org")
Aquí tienes una lista de espejos para R.
Esto es lo que hago, que es básicamente directamente del example(Startup) página:
## Default repo
local({r <- getOption("repos")
r["CRAN"] <- "http://cran.r-project.org"
options(repos=r)
})
Qué esta en ~/.Rprofile.
Editar: Como estamos ahora en 2018, podemos agregar que durante los últimos años la URL "https://cloud.r-project.org" ha sido preferible ya que refleja a) acceso https yb) una CDN “siempre cerca de usted”.
Soy un fan de:
chooseCRANmirror()
Lo cual imprimirá la lista de espejos en la salida (sin preocuparse por una ventana emergente ya que la está ejecutando desde la terminal) y luego ingrese el número que desea.