Ya no tienes que investigar más en otros sitios ya que estás al espacio necesario, poseemos la respuesta que buscas pero sin liarte.
Solución:
Copie los archivos a algún directorio bajo la raíz del proyecto usando su administrador de archivos favorito o agregue el directorio que contiene sus archivos al proyecto usando Settings (Preferences en Mac) | Project Structure | Agregar raíz de contenido.
No estoy seguro de obtener lo que desea, pero hay una manera de agregar una fuente existente al proyecto: Archivo -> Configuración -> Estructura del proyecto -> Agregar raíz de contenido -> elegir carpeta con código existente
Para PyCharm 2017 (v.2017.2.3), es ligeramente diferente. Todavía necesita copiar los archivos que desea agregar a un directorio bajo el propio directorio raíz del proyecto, pero no aparecen en la ventana de navegación del Proyecto en PyCharm inmediatamente. Para corregir esto, haga clic en el nombre del proyecto en la ventana de navegación para colapsar la estructura de árbol del proyecto y luego ábralo nuevamente. Ahora debería poder ver los archivos que acaba de agregar.
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