Al fin luego de mucho trabajar hemos encontrado la respuesta de este atascamiento que muchos usuarios de nuestra web presentan. Si tienes algo que compartir puedes dejar tu comentario.
Solución:
Cambia la configuración de tu editor:
Configuración → Editor → General → Asegurar avance de línea al final del archivo en Guardar
Para usuarios de MAC:
Preferences > Editor > General > Ensure line feed at file end on save
IntelliJ IDEA 2016.3
Enfoque 1
Expediente > Ajustes… > Editor > General > Asegurar salto de línea al final del archivo en Guardar