Esta duda se puede solucionar de variadas maneras, sin embargo te damos la que para nosotros es la resolución más completa.
Ejemplo 1: consola clara de python
import sys, os
os.system('cls')
Ejemplo 2: cómo borrar la consola python
import os
os.system('cls'if os.name =='nt'else'clear')
Ejemplo 3: limpiando la terminal en python
import os
os.system("clear")print("Hello!")#Only Hello will be in the terminal
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