Solución:
Como dijo Stephan en el comentario, la forma de agregar botones es la siguiente:
output$mytable1 <- DT::renderDataTable(
DT::datatable(
{ plots.dfs()[[1]] },
extensions="Buttons",
options = list(
paging = TRUE,
searching = TRUE,
fixedColumns = TRUE,
autoWidth = TRUE,
ordering = TRUE,
dom = 'tB',
buttons = c('copy', 'csv', 'excel')
),
class = "display"
))
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